La Real Academia de Bellas Artes y Ciencias Históricas de Toledo fue fundada el día 11 de junio de 1916 por un grupo de profesores en Historia y Arte, y reconocida oficialmente con categoría de Primera Clase por Real Orden del Ministerio de Instrucción Pública y Bellas Artes de 29 de mayo de 1917.
La medalla de académico numerario comenzó a otorgarse a partir del 11 de junio de 1916, con un número inicial de veinte. Inicialmente se asignaron por sorteo entre los veinte primeros académicos y posteriormente se otorgan al académico o académica que cubre la vacante del último poseedor.
A partir de 1973 se añadieron las medallas XXI, XXII, XXIII, XXIV y XXV, por lo que actualmente son veinticinco las medallas en vigor, una por cada plaza de académico numerario.